依據公立醫療機構人員獎勵金發給要點等相關規定，醫院係按其年度事業收支總淨餘數之一定比例發給醫事人員獎勵金。惟健保支付制度下，醫院之實際收入須經衛生福利部中央健康保險署（下稱健保署）結算確認後方予確定，爰獎勵金自應配合健保醫療款之核減或補發情形為一致性處理，即醫院應自健保確定給付之日起追扣或補付獎勵金。

審計部查核指出，國軍退除役官兵輔導委員會（下稱退輔會）榮民總醫院所屬分院有未追扣溢發獎勵金的情形。案經監察院調查發現，臺北榮民總醫院新竹分院（下稱新竹分院）未積極辦理89至92年溢發獎勵金追扣，係遲至103年始發函追扣溢發獎勵金，亦一再拖延未予檢討相關人員疏失責任，遲至103年方成立專案調查小組並決議懲處名單，導致已逾公法上請求權5年時效與公務人員懲處權10年時效，不但造成部分獎勵金無法收回，且應負疏失責任人員卻只能免議處理，顯然有嚴重違失。

調查亦發現，退輔會未及時有效督促新竹分院改善，在明知溢發獎勵金應予追扣的情形下，竟以「實務上不易追扣」等理由，答復審計機關不予追繳，對於新竹分院獎勵金請求權及人員懲處權罹於時效的結果，應負督考不力之責任，爰依法提案糾正。

在監察院督促下，退輔會自106年度起要求各榮民總醫院定期追蹤其與所屬分院的健保結算情形，並每年辦理分院獎勵金查核作業等；該會亦請各分院每月召開對帳會議，討論相關醫療帳務，避免類似案件再次發生。