南投縣政府為解決防汛期間土石淤積問題，增加防汛期的洪水排放功能，自101年起至103年6月底止，辦理土石疏濬工程類採購，決標總額新臺幣（下同）2億8,986萬餘元，同期間並辦理財物變賣之土石標售，收入總計14億1,163萬餘元。

前述南投縣政府土石疏濬工程採購作業，經審計部查核異常，監察院有感於公共工程品質攸關人民生命財產安全，積極展開調查，發現該府公文內部管理鬆散，越權核定同意承攬廠商違法外運大石公文，且發文未併同副知保全廠商、警察機關以落實監控機制，導致直徑逾5米之大石違法外運後無法追回，既造成政府財政收入減少，又讓疏濬後之大石無法堆疊於兩岸，以養灘護坡，錯失河防安全雙重保障的機會。

另低價搶標影響公共工程品質，採購機關如認有降低品質、不能誠信履約之虞或其他特殊情形，應限期通知最低標廠商提出說明，並注重「廠商說明之合理性」，然南投縣政府僅憑最低標廠商有將工項逐一量化說明，及來函保證施工品質及誠信履約，卻未確實檢討分析各工項量化說明之合理性，衍生品質降低之風險。

監察院於調查後糾正南投縣政府，並持續追蹤改善情形，期促進該府改善缺失，加強公共工程品質管理，並落實政府採購法相關規定。對於公文內部管理，南投縣政府現已針對其經辦事務加以細分，逐一規範核定權責及應副知對象；另經濟部水利署第四河川局亦已要求該府，一公尺以上之大石原則不能外運，並需置於該局指定位置，以加強河防安全。為改善低價搶標問題，南投縣政府亦修訂作業辦法，透過罰則與加強稽核，嚇阻低價搶標影響工程品質或衍生不法情事。