台灣省政府48年廢止「台灣省海埔新生土地開發辦法」，引發民怨，內政部承接該業務後，89年訂頒相關作業要點，101年又廢止該要點，引發民眾對政府出爾反爾、罔顧人民權利的積怨，監察院內政及少數民族委員會102年5月9日通過並公布監察委員吳豐山、尹祚芊、錢林慧君、劉玉山提案，糾正內政部。
糾正案文指出本案缺失如下：
一、 台灣嘉南沿海早期海埔新生地，多為沙洲潟湖地形浮覆後，經當地居民胼手胝足，辛苦圍墾而私有原生，對當時漁業發展貢獻良多。
二、 台灣省政府於44年至47年受理人民申請登記開發海埔新生地，並公告開發區域圖及訂頒「台灣省海埔新生土地開發辦法」，作為人民開發後取得土地所有權的依循，省府48年廢止該辦法後，未盡善後職責，致土地權屬爭議延宕數十年，民怨既深且久，內政部未考量前車之鑑，在承受該業務並於89年訂頒「台灣省嘉南三縣市海埔新生地所有權取得作業要點」後，因循敷衍，十餘年來無具體作為，又計畫廢止該要點，激發人民對政府出爾反爾、罔顧權利的積怨。