原行政院衛生署（現衛生福利部）倉促施行補充保險費制度，造成扣繳作業複雜化，增加健康保險署及扣費義務人鉅額行政作業成本，滋生諸多爭議及不公平亂象，致民眾怨聲載道，監察院財政及經濟委員會102年11月6日通過監察委員馬秀如、尹祚芊提案，糾正衛生福利部。
糾正案文指出，原衛生署未能利用實證數據，分析扣繳作業成本，提供政策制定及立法參考，造成採行扣繳作業複雜，增加民間企業負擔扣繳行政成本，每家民間企業負擔之承辦人加班費超過支付給健保署金額的4%，再加計民間企業及健保署負擔之其他成本，次次扣費繳交而全年不結算之成本，與其效益相比，嚴重失衡，原衛生署漏未估計提供重大攸關資訊，顯有違失。