監察院司法及獄政委員會於105年11月及106年1月提出2份調查報告，分別針對刑事訴訟法鑑定制度之缺失，提出多項意見。前者對於鑑定證據未能受到切實檢視，及司法人員普遍缺乏判讀科學證據能力，致生冤抑乙節，經參考各國法制，並綜整各機關團體與學者專家意見，提出應強化檢察官科學辦案能力之職能訓練，建立迅速與妥適之鑑定意見審查制度，及層級化與多元化科學鑑定(識)系統等建議，以提升鑑識機關之公正性；後者則針對測謊鑑定之要件、程序、採認，尚無一定準則規定，且測謊鑑定機關各自訂定不同之標準作業流程，規範未能一致，恐致當事人受到不公平對待，並侵及人格權，建請司法院及行政院實有審慎研議及適用之必要。
財團法人民間司法改革基金會前就江國慶案、蘇建和案、后豐大橋墜橋案及呂介閔被訴殺人等案件，到監察院陳訴，認上開案件存有嚴重之科學鑑識錯誤;另亦針對上開案件涉及測謊鑑定之準確性及證據之證明力，提出質疑，監察委員調查及提出調查報告，經監察院司法及獄政委員會決議通過，函請行政院、司法院及法務部等相關機關參辦，並檢討改進函復。
監察院指出，鑑定之正確性攸關當事人之權益甚鉅，有關司法科學、鑑定機制與專家證人等，已列入總統府司法改革國是會議之討論議題，相關主管機關允宜正視，以維司法公正性。