糾正案文指出：查史博館於八十四年八月間，與中華民國海下技術協會簽訂之「澎湖海域古沉船發掘初勘委託合約書」第十三點規定：「『澎湖海域古沉船發掘初勘計畫書』為本合約之附件，並與合約具同等效力。」而前該發掘初勘計畫書第五點有關「海下測勘作業設備、潛水作業人員及消耗品費用分析」乙節明載：「﹙一﹚作業設備〈1〉主工作船壹艘基本需求：1須有八員以上的住艙船位與合理的衛浴設備。…5須有四點拋錨及起錨能力。…」。然經監察院洽請水試所提供海富號試驗船相關配備查證結果，該船住艙船位僅可容納五員﹙不含船員艙位﹚，且僅具二點拋錨及起錨能力，顯與前揭委託合約書所載之主工作船基本需求內容不符。史博館於辦理「澎湖海域古沉船發掘初勘」案時，事前未就受託機構所提供之主要設備，詳實審核並嚴促履約，已有可議；事後於辦理合約經費核銷作業時，明知受託機構所報租船費用內容，含海富號試驗船，竟疏未洽詢水試所，進一步查證憑證內容真偽，即予撥款核銷，致生該案日後訟累，核其行政作為，確有瑕疵。
糾正案文復指出：水試所另有下列四點違失：
﹙一﹚ 試驗船之撥借運用，僅憑單位主管人員行政裁量，毫無具體規範可循。
﹙二﹚ 「海富號」試驗船之用船申請、及出海程序不備之情形，即貿然出海，顯有違失。
﹙三﹚ 對於試驗船燃油之核購及使用情形，欠缺有效控管機制。
﹙四﹚ 部分試驗船幹部船員，資格不符規定。