監察院財政及經濟、內政及少數民族、國防及情報委員會本(97)年11月18日(星期二)通過並公布劉委員興善所提糾正行政院衛生署、國防部案。案由為：行政院衛生署及國防部在辦理澎湖地區醫療整合作業，僅遷就於現有醫療資源合併，而忽略醫療體系間之法令、人事、財務等差異，造成整合過程扞格不入、作業延宕；署立澎湖醫院辦理醫療大樓改建工程，未確實評估該院之定位與效益，致屢遭行政院退回，嗣未依核定規模辦理設計，致延宕發包期程及影響建物功能，均核有違失。
糾正案文指出：澎湖醫院「醫療大樓改建工程」與興建中之國軍澎湖醫院醫療大樓，有重複投資及浪費醫療資源之虞，經衛生署邀集國防部、國軍澎湖醫院、三軍總醫院等相關單位，召集會議討論結果，確認澎湖地區醫療整合由三軍總醫院負責規劃，初期並先以業務委託方式，將署立醫院委託三軍總醫院經營。然因軍方體系與行政體系不同、管理型態亦有差異，軍職人員皆須辦理退伍程序；衛生署每年公務預算補助署立澎湖醫院逐年遞減，造成署立澎湖醫院醫師獎勵金大幅下降，原署立澎湖醫院醫師相繼去任；藥師無法聯合值班，健保分開申報，藥品品項尚未統一，無法相互使用藥材，病人無法於兩院互相領藥；藥衛材因軍聯標及署聯標有異，無法合併採購；醫院資訊系統没有在同一平台建立互通系統；兩院收費及優惠（減免）對象不一等。皆為醫療體系間之法令、人事、財務之差異，而產生整合作業扞格及延宕。
糾正案文並表示：署立澎湖醫院於47年興建，已結構老舊，尤其在921大地震後，建物部分樑柱下陷、地板裂痕，安全堪虞。故於91年6月由衛生署呈報行政院該醫療大樓改建計畫，惟所提報計畫與興建中之國軍澎湖醫院醫療大樓有重複投資、浪費醫療資源之虞，且未依規定評估改建後之財務及營運狀況等預期效益，嗣後署立澎湖醫院提報之計畫再遭行政院質疑其計畫效益與可行性，顯見其未能覈實擬編改建計畫，且屢次未依審議意見妥適修改計畫內容，肇致報核過程冗長，耗費行政資源。此外，該工程未依核定規模辦理設計，預算對照建築規模價格偏低，致延宕發包期程，又減項減量發包，影響建物正常使用功能，均核有違失。