監察院財政及經濟委員會、內政及少數民族委員會、交通及採購委員會聯席會議，於本（98）年8月5日通過並公布高鳳仙委員所提糾正行政院暨所屬經濟部、農委會、營建署、中央氣象局等5個中央機關，以及台中市縣、彰化縣、南投縣、雲林縣、嘉義縣、台南縣、高雄縣及屏東縣等9個地方政府案，送請行政院督飭確實改善處置。
糾正案文愷切指出：行政院長期未以流域觀念統合水患治理事權，且迄仍以任務編組之臨編單位（內政部營建署下水道工程處）統籌全國下水道建設及管理業務，亦未見積極解決各級水利機關人力不足問題，影響整體治水成效。經濟部水利署自詡每年編列百餘億元預算辦理相關治理工程，卻未落實「易淹水地區水患治理計畫」流域整體規劃治理觀念，適時調整相關預算，同步進行中央管河川及排水之疏濬治理工程，迨至卡玫基颱風718水災後，始依據總統及行政院院長巡視指示，採移緩濟急原則，針對土石淤積影響排洪而有釀災之事實，調整各工作項目經費優先辦理，有損機關形象與整體治水成效。農委會水保局及林務局，主政河川上游水土保持與治山防災工作，卻置任河川上游崩塌土石長期堆積而不疏濬清除，每逢豪雨即隨洪水沖刷而下，淤塞下游河道、抬升河床，除增加溢堤風險外，亦造成支流及區域排水之內水無法排出而溢淹成災，招致水患治理成效不彰、浪費公帑之訾。交通部中央氣象局對於卡玫基颱風中南部雨量預報，初期預報之雨量與實際降雨量之落差過大，復因未對於97年7月18日清晨持續性降雨及時提出預警，使相關縣市政府未能於民眾上班、上課前宣布停班、停課，致民眾未及防範而造成財產損失甚至危及生命安全，徒增民怨，均有怠失。
在「易淹水地區水患治理計畫」推動執行方面，監察院糾正水利署、營建署及農委會，未善盡中央執行機關能事，導致計畫執行進度多有落後。其中以水利署負責執行之「河川排水及事業海堤改善」落後情形較為嚴重，第1階段屆期（97年6月底）時，預算達成率僅63.38﹪，延至今（98）年7月仍有將近四成（38.3﹪）工程未完工；第2階段執行期程迄今年6月底已屆半，預算達成率竟僅15.27﹪，核定之68件工程中，僅發包30件、完工3件（占4.41﹪）。而營建署負責執行之「雨水下水道改善」，第1階段屆期時，預算達成率僅94.07﹪；第2階段執行期程已屆半，預算達成率卻僅32.42﹪，核定之88件工程中，已發包71件，僅完工29件（占32.95﹪）。農委會負責執行之「農田排水、上游坡地水土保持及治山防洪」，第1階段屆期時，預算達成率僅96.04﹪，第2階段執行期程已屆半，預算達成率卻僅34.03﹪，核定之55件工程中，已發包44件，僅完工18件（占32.73﹪）。顯示各該部會執行「易淹水地區水患治理計畫」，自始進度即一再落後，致影響整體治水成效。
另針對卡玫基颱風718水患較嚴重之中南部9個縣市政府，糾正案文亦逐一詳列針砭：台中市、縣及南投縣，迄未設立一級水利單位（處），仍由二級單位（科）負責執行水患治理工作，編制員額僅2~10人，顯然不足；而其他已設立一級水利單位之6個縣，亦因人力調配運用狀況未盡合理，致成水患治理推動執行掣肘。其餘尚有雨水下水道疏於維護管理、排水系統規劃施工不當、執行水患治理計畫及颱風災後復建工程進度落後、都市化過程未考量逕流增加及滯洪空間減少等諸多違失，爰監察院依法提出糾正，要求行政院確實督促改善。