針對莫拉克颱風造成南台灣50年來最嚴重災情，政府防災體系是否充分發揮應有功能，將災情減少到最低程度，監察院趙昌平委員於本(8)月10日申請自動調查。
趙昌平委員表示：此次莫拉克颱風造成民眾生命、財產莫大損失，南台灣許多房舍、田園流失，農田毀壞、路基坍塌、橋樑斷裂，實在令人怵目驚心。這雖是天災，同時也是人禍，一個負責任的政府不能將所有災害完全歸責於「天災」。值此救災緊急時刻，為了不影響政府整體救災工作，監察院調查重點將放在「政府防災體系」，回溯政府平時防災措施。「一元防災，重於十元救災」，如果政府平時做好防災措施，就不會發生如今慘況。
氣象局最主要的工作在於對民眾提出預警，以讓民眾有充足的準備，防範災難的發生。氣象局的預警設備是否足夠？預測雷達是否老舊而不足以發揮作用？氣象局人員的預警及解讀能力是否完備？這些都是未來調查的重點。
趙昌平委員表示，台灣河流的特性為短速急流，因而洪水衝擊力道較大，當強烈山洪爆發時，造成的損失將相當慘重。政府撥付1、2千億的治水經費，究竟績效何在？此治水經費是否發揮功效？這是未來調查的重點之一。若查有違失，將依法追究違法失職的行政機關及政府官員。監察院目前以不影響救災工作為主，但趙昌平委員提出自動調查，目的在於強調防災為政府應負的責任。
趙昌平委員再度強調：萬事莫如救災急，監察院此次調查以不影響政府救災為最高原則，希望政府傾全力投入災區救治及重建之相關工作。