行政院衛生署疾病管制局辦理H5N1疫苗採購，決策欠缺周延，對於庫存防疫物資，也未能有效運用，導致許多檢驗不合格且過期的防護裝備未能及時處理，浪費公帑，監察院財政及經濟委員會99年7月20日通過監委錢林慧君、尹祚芊提案，糾正行政院衛生署疾病管制局。
糾正案文指出本案缺失如下：
一、疾管局對於庫存防疫物資，其中防護裝備包括N95口罩、防護衣、隔離衣等，審計部98年3月抽查時，發現該局庫存防疫裝備總值約2億5千餘萬元，監委於98年11月調查發現，相關庫存物資總值已達4億1760萬元。疾管局未能落實全國性物資調度運用機制，以提昇物資效能，甚至到99年4月猶未能處理完畢，對於已屆效期，且檢驗不合格之防護裝備，未能儘速依規定處理，徒增不經濟倉儲支出，應檢討改進。
二、疾管局採購H5N1疫苗方面，決策欠周延，又未能加強宣導接種，以提昇疫苗使用效益，95年所採購之19萬劑疫苗，僅於96年7至8月間完成該局境外防疫大隊19人自願接種，97年4至9月完成其餘類別人員之自願接種作業共419人；95年間辦理H5N1疫苗購案，未規劃後續疫苗倉儲事宜，更不當引用後續擴充之條款，甚且追溯合約生效日期，應切實檢討改進。