交通部委由監理機關徵收汽車燃料使用費，清理欠費效能不彰，交通部未善盡主管機關之責，訂定相關配套措施及建置刪除欠費課責之機制，並切實督促公路總局加強考核，監察院交通及採購委員會99年8月11日通過並公布監委沈美真提案，糾正交通部。
糾正案文指出本案缺失如下：
一、截至98年底，汽車燃料使用費未徵數計有160.17億元，監理機關未積極完成法定送達及移送執行程序，且債權憑證管理鬆散，多年來清理欠費效能不彰，肇致政府因未於法定時間內行使請求權而消滅，各監理機關94至99年自行刪除列管逾法定請求權時效之欠費案件，金額計70億1,208萬餘元。監理機關對逾時欠費案件逐年擴增，卻未積極研謀因應對策有效改善，亦未於屆滿期限前1年將欠費案件移送執行，並追究相關人員有無怠忽責任，顯有欠當。
二、交通部對於汽燃費欠費清理作業效能欠佳，未訂定相關配套措施，及建置刪除欠費課責之機制，對逾法定時效之欠費案件，未檢討辦理過程有無疏怠責任，且忽視各監理機關刪除欠費金額逐年遞增之情事，未切實督促公路總局加強考核，導致逾法定時效，而使公法上請求權消滅之欠費案件有增無減，未善盡主管機關之責。