行政院環境保護署辦理「鼓勵公民營機構興建營運垃圾焚化廠推動方案」，未適時評估修正建廠計畫，造成10座焚化廠停建及虛擲先期行政作業經費達1.2億餘元，監察院財政及經濟委員會99年9月8日通過並公布監委楊美鈴、程仁宏提案，糾正行政院環境保護署。
糾正案指出本案缺失如下：
一、行政院環境保護署以舊有資料陳報行政院核定推動方案，未考量實際垃圾清運量及推動資源回收政策，適時評估修正建廠計畫，肇致停建10座焚化廠，虛擲先期行政作業經費達1.2億餘元，並因停建產生訴訟爭議，斲傷政府施政形象，核有疏失。
二、行政院環境保護署未主動評估停建焚化廠之必要性，俟行政院要求檢討後始分3次提報，過程長達近5年，檢討修正作業欠缺效率。
三、行政院環境保護署雖設置專責單位統籌推動焚化廠興建事宜，惟對於地方政府執行所遇困難，未能適時協助改善，任令延宕，造成焚化廠營運期程嚴重落後，應負督導不力之責。