交通部及所屬高速鐵路工程局草率同意變更高鐵機電核心系統，致台灣高鐵淪為歐、日規混血系統，每百萬公里發生之行車事故件數，較日本新幹線高出許多，嚴重影響民眾安全權益，監察院交通及採購委員會99年11月10日通過監委程仁宏、楊美鈴、陳永祥提案，糾正交通部及所屬高速鐵路工程局。
糾正案文指出，交通部未詳細評估混用歐、日二系統之技術可行性、穩定度、安全性及對整體時程與造價之影響等因素，致台灣高鐵形成首見德國高號數道岔與日本機電核心系統的組合，通車營運3年迄今發生31起道岔訊號異常事件，列車到站時間遲延30分鐘以上者達129列次，受影響旅客數87,601人，退費金額達5,859萬餘元，每百萬公里發生之行車事故件數，較日本新幹線高出許多，造成行車安全顧慮，也影響旅客權益至鉅。
糾正案文表示，交通部及所屬高速鐵路局迄未認真檢討缺失，並加強監督業者的營運品質，反而以台灣高鐵採高號數道岔、同時驅動多轉轍器等理由辯解，確有違失。