九二一地震後，教育部委託臺灣大學推動「竹山車籠埔斷層槽溝保存計畫－地震及生態園區」，臺大未能如期發包，交由國立自然科學博物館執行，科博館與廠商發生履約爭議，迄今未完成發包，監察院教育及文化、交通及採購委員會100年3月10日通過監委趙榮耀、程仁宏提案，糾正教育部、國立自然科學博物館。
糾正案文指出，本案違失包括：
一、本案原執行單位臺灣大學爭取執行本計畫後，執行計畫內容及前置作業欠周延，主管機關教育部未積極協調後續經營管理事宜，逕行提出替代方案，導致工程無法如期發包及臺大拒絕續辦。
二、科博館未依原計畫及經費需求，嚴格管制與及早確定細部設計內容，任由承包商大幅增加工項，衍生履約爭議而終止契約，教育部未善盡監督之責，皆有疏失。
三、科博館未依教育部的建議，堅持與承包商終止契約及提起訴訟，導致相關救濟或訴訟結果皆不利於該館，浪費公帑，顯有不當。
四、本計畫歷經3次修正及重新辦理發包，已延宕3年5個月，教育部及科博館仍未積極進行興辦，並延宕修正計畫的提報時程，重新發包將衍生3千餘萬元的物調款，確有不當。