經濟部規劃太陽光電之躉購政策及設置管理辦法，施行後發現有重大瑕疵，該部未與民眾、業者協調下，自行修改規定，倉促公告，引發地方反彈抗爭，有違誠信原則，監察院財政及經濟委員會100年6月8日通過監委趙榮耀、劉玉山提案，糾正經濟部。
糾正案文指出本案5項缺失如下：
一、 經濟部99年4月間修訂發布施行之「再生能源發電設備設置管理辦法」，容許業者申請再生能源發電設備，經認定後由簽約至完工，期程可長達2.5年，且簽約後連續躉購20年，導致辦法施行不及半年，發現業者申設量失控、延後完工，以求厚利，造成全民電費負擔將巨額增加等嚴重問題，始倉促修正躉購費率及其計算公式，引發廠商抗爭。
二、 依據經濟部99年1月25日公告「中華民國99年度再生能源電能躉購費率及其計算公式」， 98年7月10日至99年12月31日間完成簽約者，皆按當時公告之躉購費率辦理，造成依100年公告費率並於當年完工業者之費率，遠低於依99年公告費率且100年或101年上半年始完工者之不合理現象，經濟部未能及早預見，顯然未盡職責。
三、 經濟部於99年12月17日再度公告修正再生能源電能躉購費率及計算公式，事前未與業者協商，又未預擬配套措施，違反誠信原則，引發業者抗爭，損及政府形象。
四、 經濟部於99年12月17日公告修正躉購費率及計算公式時，未預先給予業者合理緩衝時間，引發抗爭後，才因立法院決議，同意業者延長2個月完工，行政考量欠周。
五、 林邊、佳冬鄉農民參加「養水種電」專案，因經濟部片面將收購太陽能發電躉購費率計算方式，由簽約日改為完工日，引起業者反彈和農民恐慌，經濟部曾允諾100年2月15日提出處理方案，惟屆期仍未定案，再次失信於民，有損政府威信。