監察院100年12月2日到行政院進行年度巡察，監委針對近一年來，行政院所屬相關部會，發生的施政重大缺失，例如輕忽食品安全的把關，造成塑化劑危害消費者健康風波；全國土地違規使用嚴重；國內海關、法官、署立醫院、學校營養午餐的貪腐嚴重，暨駐外人員風紀問題等，要求行政院具體改善，而非「實問虛答」、敷衍應付了事，以符人民的期望。
行政院長吳敦義除指示各部會首長對於監委巡察提出詢問，要「實問實答」，對於監察院建言，也應具體落實檢討改進。
今年監察院巡察行政院，擔任領隊的內政及少數民族委員會召集人吳豐山表示，監察院今年截至11月18日止，共通過25個彈劾案、彈劾46人。除各級法院8人最多外，行政機關依序排名為經濟部暨所屬機關、台中市政府暨所屬機關各有7人，國防部暨所屬機關6人、新北市政府暨所屬機關3人。另外通過2個糾舉案、糾舉2人。
吳豐山委員說，在糾正案方面，截至11月底，通過糾正185個糾正案(276案次)。被糾正機關依序排名為國防部暨所屬機關26案次最多；其次為交通部暨所屬機關20案次；內政部暨所屬機關18案次；財政部暨所屬機關、經濟部暨所屬機關，教育部暨所屬機關，法務部暨所屬機關各16案次。
吳豐山指出，在監察委員獨立行使調查職權下，發現行政機關辦理業務所依據的法律或規定，與當前社會環境脫節，要求行政機關應儘速檢討修法，目前已有14項完成修法工作。
隨後監察院依據內政、外交、國防、財政、教育、交通、司法等7個委員會推派代表提出建言，分別針對公共安全事件之監督；縣市警局對職業賭場、色情場所之督察及政風單位稽察失靈；駐外人員風紀；國軍裝備暨軍品後勤管理及眷村改建；國軍戰備訓練暨軍事教育；國防轉型；國營事業經營管理與投資績效；食品安全衛生；高等教育因應少子化及國際化；軌道運輸系統防護；老舊車輛退場機制；毒品防制；防貪肅貪成效等議題提出詢問。
另外也有7名委員發言，對於土地違規使用、房價、檢察官養成教育、兩岸投資與司法互助、流浪狗影響環境及危害人車安全、太極門的逃漏稅案、弱勢家庭、貧富差距、反毒、桃園國際機場管理、農產品的產運銷間價格、法醫師法、酒品及檳榔健康捐、長照計畫等議題提出詢問。