臺北都會區大眾捷運系統新莊線新莊機廠選址不當，引發民間社團強力抗爭，臺北市政府捷運局設計、施工不當，導致新莊機廠完工期程嚴重延宕64.5個月，驟增預算85億元，主管機關難辭其咎，監察院教育及文化、財政及經濟、交通及採購委員會101年8月16日通過監委陳永祥、周陽山、馬以工提案，糾正新北市政府、衛生署、臺北市政府捷運工程局。
糾正案文指出，本案違失包括：
一、臺北捷運新莊線新莊機廠選址不當，且需占用大部分樂生療養院所在地，導致遭各界強力抗爭反對，數度爆發衝突，新北市政府及臺北市捷運工程局難辭其咎。
二、衛生署及所屬樂生療養院移交施工用地及遷離院民顯有不力，導致新莊機廠完工期程嚴重延宕，確有怠失。
三、新莊機廠選址不當，除需開鑿隧道外，且大規模開挖山坡地，需以工程極端手段解決逆衝斷層等地質先天不良問題，導致預算驟增、時程延宕及工程安全不確定，新北市政府、臺北市政府捷運局應記取教訓，勿重蹈覆轍。
四、臺北市捷運局未確實審核設計圖說，輕忽40公尺高度大邊坡的開挖風險，導致樂生療養院續住區與新院區部分建物及地坪裂損，工程因而全面停工、重新檢討補強，應確實檢討改進。