我國科技預算每年高達近千億元，但行政院所屬各機關每年之研發成果僅為七億餘元；國內產業每年匯出國外智慧財產權利金高達千億元，而匯入僅約七、八十億元，行政院對智慧財產投入鉅額資源卻未能有效產出，績效不彰，難辭違失之責，監察院財政及經濟、教育及文化委員會聯席會議99年6月2日通過監委黃煌雄、趙榮耀提案，糾正行政院。
糾正案文提出本案缺失如下：
一、 國內近5年相關產業匯出國外之智財權利金或授權金，2006年至2008年均近千億元，2009年則超出千億元；惟匯入之智財權利金或授權金，僅約七、八十億元，兩者不成比例。
二、 中央政府科技預算2005年為704餘億元，2009年增至910餘億元，但各部會（資助機關）繳交科發基金之科技研發成果收入權利金，2005年僅7億餘元；2007年7億6千多萬元；2006、2008、2009年7億7千多萬元，毫無進步。
三、 我國智財之投入與產出落差太大，績效不彰，智財研發、產出、運用及管理之機制顯有不當，行政院難辭其咎。